根据美国疾管专家表示，甲型H1N1流感侵袭肺部深处引发呼吸衰竭是许多民众的主要死因，病程如果拖的愈久，就愈容易并发感染危机。原本就罹患宿疾者在感染后，导致死亡的机率会更高。

　　据台湾“今日新闻”报道，台当局“卫生署”表示，这次新流感疫情中，已有6起死亡病例，其中死亡和病情严重者都有新流感病毒侵袭肺部的症状，有2、3名新流感细菌持续发作患者，他们的病程拖得更久。

　　根据海外专家研究发现，新流感死者的肺部受损情况和H5N1禽流感死者相同，都是病毒破坏肺部深处，这和季节性流感病毒只攻击上呼吸道系统，有着明显的不同。

　　美国疾管专家表示，极度肥胖、高血压或慢性心脏病患者、哮喘患者、糖尿病患及免疫系统薄弱者，都是属于新流感的高死亡率族群。在台湾地区，有3成的住院病人罹患潜在疾病，其中4个死亡病例中还患有洗肾、癌症、多重障碍等宿疾，但人数较稀少，至今还未能做出精确论断。

　　台当局“卫生署”说明，部分死亡病例从发病到死亡，只有短短7、8天，目前岛内缺乏病例解剖报告，仅能确定新流感病毒没有突变情况，患者也没有类似禽流感引起免疫风暴的情况，推测可能与病人的体质基因有关。